Au pif, en vrac et sans grande réflection.

Le plus simple, c'est de décaler tes partitions linux pour mettre celle windows au début.
Il faudra en plus changer la config de grub et /etc/fstab

Mais le plus bizare c'est que windows devrait au moins te proposer de tout virer sur ton disque. Il n'y aurai pas une histoire de driver sata ou un partitionnement pas propre dans tout ça?

Si tu vires la partition NTFS et que tu laisses faire windows, il se passe quoi?