Je n'ai jamais configuré moi-même ces outils mais on utilise Nagios et Cacti.
Un ami à lui opté pour Zabbix et en est très content.
On étudie aussi les possibilités de Centreon (regroupement de Nagios et Cati mais avec des interfaces plus jolies et des plus grandes possibilités de graphs, vues pour des users, ...)

On m'a aussi parlé de smokeping qui est plus précis que Cacti.

Ou alors, vu chez un client, le top, le système ultime de monitoring ... qques fenêtres avec un "ping cilbe -t" et quelqu'un qui regarde s'il y a pas trop de "request time out"