Une piste :
http://linux.developpez.com/faq/?page=configdebian#aptget_version

Maintenant si c'est en stable qu'ils ont changé de version ça va être un peu plus dur...

Mais je ne comprends pas : quand mysql change de version, je n'ai jamais eu aucun problème avec mes bases, je n'ai dû faire aucun upgrade manuel...