Lors d'une conférence en ligne, Nintendo a expliqué le fonctionnement de la mémoire Flash qui est inclut dans la console. Dans le pack de 8 Go (à 299€), seuls 3,2 Go seront disponibles pour l'utilisateur, le reste étant alloué aux fichiers système ainsi qu'aux profils des joueurs. Dans le Premium Pack de 32 Go (349€), 24.8 Go sont accessibles seulement.

Pour bénéficier d'un espace plus large, il est possible de brancher une clé USB ou bien un disque dur externe (jusqu'à 2 To).