Transmeta a attaqué Intel en octobre 2006 affirmant que la firme utilisait des technologies brevetées en matière de consommation et d'architecture dans ses Pentium 3, 4, M, Core et Core 2 ce à quoi Intel répondait à Transmeta qu'ils avaient eux aussi de nombreux brevets à agiter.

Alors que l'on annonçait une longue et pénible bataille en justice, Intel a accepté de transiger et à payer 150 millions de dollars directement et 20 millions de dollars par an sur les 5 prochaines années. En plus de cela, Transmeta et Intel se sont donné des droits mutuels sur leurs brevets.